La denuncia de la Procuraduría de Investigaciones Administrativas ya obtuvo requerimiento de instrucción y tramita ante el Juzgado en lo Criminal y Correccional Federal N° 12, que hizo lugar a varias de las medidas solicitadas por el Ministerio Público tendientes a verificar los ilícitos denunciados.
El caso se inició a raíz de una auditoría efectuada por el Ministerio del Interior y Transporte de la Nación que determinó diversas irregularidades en la contratación de sistemas informáticos por parte de las UGOFE S.A. (conformadas por las empresas Ferrovías, Metrovías, y TBA S.A.) y UGOMS. S.A. (a cargo de las líneas Sarmiento y Mitre). Las maniobras sospechadas involucran contrataciones que podrían no haber sido necesarias ya que se contaba con otros recursos informáticos y además se advirtió que en ningún caso se respetaron los procedimientos administrativos vigentes para este tipo de contrataciones. En todos los supuestos la beneficiada fue la firma Prominente S.A. que a la postre resultó integrante del grupo económico Roggio - controlante de Metrovías S.A.-. Asimismo se determinó que los responsables de tramitar dichas contrataciones en las empresas ferroviarias habrían pertenecido previamente a la firma Prominente S.A. Por lo que frente a las posibles incompatibilidades advertidas las autoridades del Ministerio del Interior y Transporte aconsejaron no convalidar los pagos realizados por $24.374.259. Cabe señalar que tanto UGOFE como UGOMS operaron el servicio ferroviario por cuenta y orden del Estado Nacional lo que se estaría frente a un caso de defraudación agravada por administración fraudulenta de recursos públicos.