A través de la Resolución MP N°84/04 se creó la Unidad Fiscal para actuar de manera conjunta o alternativa con las fiscalías correspondientes, en la tramitación de la causa principal en la que se investiga el atentado ocurrido el 18 de julio de 1994 contra la sede de la Asociación Mutual Israelita Argentina (AMIA), que tramita ante el Juzgado Nacional en lo Criminal y Correccional Federal N°6. Asimismo, interviene en todas las demás causas que guarden relación con ese hecho, así como aquellas relacionadas con el encubrimiento u obstaculización de la acción de la justicia de la que pueda surgir prueba conducente al mismo objetivo.